Nato da un progetto di rigenerazione urbana degli antichi magazzini del porto e dello scalo ferroviario di Laveno-Mombello, il museo racconta la storia delle vie d'acqua che furono fonte di sostentamento e sviluppo economico e sociale di tutto il nord Italia, attraverso un’importante raccolta di scafi d’epoca, frutto della tradizione artigianale del Verbano, volumi, immagini e testimonianze. All’interno degli spazi del museo si trovano ampi laboratori di carpenteria navale, sede di corsi e workshop improntati alla salvaguardia della tradizione ed alla trasmissione degli antichi mestieri legati al lago.

La Fondazione Officine dell'Acqua è stata riconosciuta come Raccolta Museale nel 2024.